Etude de la flore bactérienne halophile cultivable des zones humides de Ouargla (Algérie)

Abstract

Les milieux hypersalins, représentés par les chotts, sebkhas et sols salins, sont un exemple typique d'environnements extrêmes abritant une flore microbienne particulièrement intéressante. Dans ce travail une approche physico-chimique combinée aux méthodes culturales et moléculaires a été appliquée à la recherche d’halo bactéries, dans les échantillons de sédiments et de saumures prélevés de deux sebkhas: Oum Eraneb et Ain El Beida, situées à Ouargla, dans le sahara Algérien. Les résultats d’analyses ont en effet revelé que ces milieux inhabituels offrent des conditions d’aridité, d’alcalinité et d’abondance en sel, aussi bien au niveau des saumures (128 et 165g /l), qu’au niveau des sédiments (1.71% et 2.26%). L’exploration microbienne de ces écosystèmes particuliers s'est avérée fructueuse. Des souches archéennes et bactériennes halophiles ont été isolées, purifiées et caractérisées. Les souches archéennes appartiennent à la famille des Halobacteriaceae l’ordre des Halobacteriales. Halophiles extrêmes, aérobies, à Gram négatif, ces souches sont alcali-thermotolérantes. L’étude phylogénétique a révélé leur affiliation aux genres Natronorubrum et Halorubrum. La souche bactérienne, aérobie, se présente sous forme de bâtonnets à Gram positif, halotolérante extrême, mésophile et alcaliphile. L’analyse comparative des séquences du gène de l'ARNr 16S, a confirmé son étroite apparentée (96%) au genre Alkalibacillus. Certes identifiée en Chine et en Inde, notre étude est la première à rapporter la présence des espèces Halorubrumlitoreum de Natronorubrumbangense ainsi que l’Alkalibacillushaloalkaliphilus C-5 dans des dépressions salées du Sahara algérien